Pada bulan November 2012, ahli virologi Mesir, Dr. Ali Mohamed Zaki mengirim sampel virus dari kes yang disahkan pertama kepada pakar virologi, Ron Fouchier, seorang penyelidik koronavirus terkemuka di Pusat Perubatan Erasmus (EMC) di Rotterdam, Belanda.[6] Kes yang terbukti dengan makmal kedua adalah di London, disahkan oleh Badan Perlindungan Kesihatan UK (HPA).[7][8] HPA menamakan virus itu sebagai London1_novel CoV 2012.

Pada 8 November 2012, dalam artikel yang diterbitkan dalam Jurnal Perubatan New England, Dr. Zaki dan pengarang bersama dari Pusat Perubatan Erasmus menerbitkan lebih banyak maklumat, termasuk nama saintifik, Pusat Perubatan Manusia Coronavirus-Erasmus (HCoV-EMC), yang kemudian digunakan dalam kesusasteraan ilmiah.[2] Dalam artikel itu, mereka mencatat empat koronavirus pernafasan manusia (HCoV) yang diketahui menjadi endemik: 229E, OC43, NL63, dan HKU1.

Pada bulan Mei 2013, Kumpulan Kajian Koronavirus dari Jawatankuasa Antarabangsa Taksonomi Virus mengadopsi penunjukan rasmi, Koronavirus Sindrom Pernafasan Timur Tengah (MERS-CoV).[9] yang diadopsi oleh Pertubuhan Kesihatan Sedunia untuk "memberikan keseragaman dan memudahkan komunikasi mengenai penyakit ini."[10]

Menjelang Mei 2013, 10 daripada 22 orang yang mati dan 22 dari 44 kes yang dilaporkan berada di Arab Saudi dan lebih daripada 80% adalah lelaki.[11] Perbezaan jantina ini disebabkan kerana kebanyakan wanita di Arab Saudi memakai tudung yang menutup mulut dan hidung, sehingga mengurangkan kemungkinan mereka terkena virus. [12] Menjelang 19 Jun 2013, MERS telah menjangkiti sekurang-kurangnya 60 orang dengan kes yang dilaporkan di Jordan, Qatar, Arab Saudi, Emiriah Arab Bersatu (UAE), Tunisia, Jerman, United Kingdom (UK), Perancis dan Itali,[13] dengan jumlah kematian 38. Pegawai Saudi menyatakan kebimbangan besar bahawa berjuta-juta umat Islam dari seluruh dunia berpotensi terkena virus semasa musim luruh Haji, atau haji ke Mekah.[14]

Pada bulan Mei 2014, WHO mengatakan sedang memantau keadaan kerana kes-kes global MERS nampaknya meningkat, tetapi mengatakan keadaan itu belum lagi merupakan keadaan darurat kesihatan. Pada 3 Jun 2014, Arab Saudi menyemak semula jumlah kes MERS di negara ini hingga 688 kes setelah memeriksa kembali data tersebut sebagai sebahagian daripada usaha untuk lebih memahami penyakit ini. Seramai 282 orang telah mati akibat MERS. Angka itu melonjak 113 kes dan 92 kematian. Walaupun terdapat peningkatan kes, jumlah kes baru menurun menurut Tariq Madany, ketua majlis penasihat perubatan. Pada waktu yang sama, timbalan menteri kesihatan Arab Saudi dipecat, pegawai kesihatan tingkat tinggi kedua dipecat dalam dua bulan.[15]

Pada 4 Jun 2014, sebuah kajian yang diterbitkan dalam The New England Journal of Medicine menunjukkan bahawa penularan virus unta ke manusia adalah mungkin. Pada bulan November 2013, seorang lelaki jatuh sakit dengan MERS setelah dijangkiti unta yang sakit. Sampel DNA yang diambil dari lelaki itu, yang akhirnya mati akibat virus itu, dan haiwan yang sakit itu hampir sama memberikan bukti yang sangat kuat bahawa lelaki itu mendapat virus dari unta.[16]